Welcome on the web page of the UMR Dynamic, ‘Genome dynamics and microbial adaptation’, a mixt unit of research between INRAE (Institut National de Recherche en Agriculture, Alimentation et Environnement) and University of Lorraine (Université de Lorraine).
The main research topic of the Unit deals with the mechanisms of fast evolution in bacteria. Horizontal gene transfer, i.e. exchanges of genetic information between related or unrelated bacteria in an ecosystem, constitutes a major mechanism of bacterial evolution.The studies include the characterization of the molecular mechanisms of transfer of genetic information, of its integration in the recipient genome and of the mechanisms of regulation of these processes, as well as the impact of the transferred sequences in the bacterial host (genome diversity, new functions, adaptation).
Two bacterial groups and their respective ecosystems are approached: streptomycetes and the forest soil on one hand, and streptococci and their different ecosystems (food, oral cavity and human digestive tract) on the other hand.
The UMR 1128 is supported by the Lorraine Université d’Excellence, and by a grants of the French National Research Agency (ANR), in particular through the « Investissements d’Avenir » program (ANR-11-LABX-0002-01, Lab of Excellence ARBRE) and is recognized by the “AgreenSkills+ programme“.
The UMR1128 is also supported by the European Union by the Regional Operational Programme of the European Regional Development Fund (FEDER-FSE Lorraine et Massif des Vosges 2014-2020, Grand Est). This program co-finances a research project for a total amount of 625 k€, the aim of which is to fight against the spread of antibiotic resistances among bacteria. This project uses transdisciplinary approaches (molecular biology, structural bioinformatics and molecular simulation) to characterize conjugation, a mechanism of gene transfer between bacteria, and to develop conjugation inhibitors.
Bienvenue sur la page d’accueil du laboratoire Dynamique des Génomes et Adaptation Microbienne (DynAMic), unité mixte de recherche entre l’INRAE et l’Université de Lorraine.
La thématique de recherche de l’unité concerne les mécanismes d’évolution rapide chez les bactéries. Le transfert horizontal de gènes, c’est-à-dire les échanges d’information génétique entre bactéries apparentées ou non d’un même écosystème, constitue le mécanisme prépondérant de l’évolution bactérienne. L’étude de ce phénomène inclut la caractérisation des mécanismes moléculaires du transfert de l’information génétique et de son intégration dans le génome hôte et des mécanismes de régulation de ces processus ainsi que l’étude de l’impact des séquences transférées chez la bactérie hôte (diversité du génome, nouvelles fonctions, adaptation).
Notre unité étudie deux groupes bactériens et leur écosystème respectif : les streptomycetes et le sol forestier (rhizosphère) et les streptocoques dans leurs différents écosystèmes (aliment, cavité orale et tractus digestif humain).
L’UMR1128 bénéficie du soutien du dispositif Lorraine Université d’Excellence, ainsi que de l’ANR, en particulier via le Laboratoire d’Excellence ARBRE (ANR-11-LABX-0002-01). Pour plus d’informations, voir la page du Labex Arbre. L’unité est également reconnue et bénéficiaire du programme d’excellence Agreenskills.
L’UMR1128 est soutenue par l’Union européenne dans le cadre du Programme opérationnel FEDER-FSE Lorraine et Massif des Vosges 2014-2020, Grand Est. Ce programme co-finance un projet de recherche d’un montant total de 625 k€ dont l’objectif est de lutter contre la dissémination des résistances aux antibiotiques entre bactéries. Ce projet utilise des approches transdisciplinaires (biologie moléculaire, bio-informatique structurale et simulation moléculaire) pour caractériser la conjugaison (un mécanisme de transfert de gènes entre bactéries) et développer des inhibiteurs de conjugaison.
